Elizabeth Holmes est née le 3 février 1984 à Washington, D.C.

Son père, Christian Rasmus Holmes IV, était vice-président d’Enron, une société d’énergie qui a ensuite fait faillite à la suite d’un scandale de fraude comptable.

Plus tard, il a occupé des postes de direction dans des agences gouvernementales telles que l’USAID, l’EPA et l’USTDA.

Christian Holmes est d’ascendance danoise et hongroise. Son arrière-arrière-grand-père Charles Louis Fleischmann était un immigrant juif hongrois qui a fondé Fleischmann’s Yeast.
Parmi les enfants de Charles Louis Fleischmann se trouvaient Julius Fleischmann, maire de Cincinnati de 1900 à 1905 et entrepreneur.

Sa mère, Noel Anne (née Daoust), a travaillé comme membre du comité du Congrès.